L’orto si trova su un livello marcatamente più basso (circa 5 metri) di quello del giardino, completamente circondato da un muro. Si tratta di un tipico esempio di “hortus conclusus”; struttura che, in epoca medievale, in particolare nei monasteri, riprendeva le prescrizioni della Regola di San Benedetto da Norcia, dettata dal monaco nel 534 d.C. Una zona dedicata agli orti (horti), una dedicata ai frutteti (pomaria), i giardini con alberi (viridaria) e infine una parte dedicata alle erbe officinali (herbaria).
Entro i confini di questa zona, oltre all’orto, si trovano vigne in parte a pergolato, alberi da frutto e una piccola peschiera. Una bealera con lavatoio scorre ai margini dell’orto e ne consente l’irrigazione.